2

答えはロムから好きなときにCPに保存出来ないからです。
一番最初に書いたようにロムからCPにセーブすることが出来るのは7月1週の自動セーブの時だけ。
仮にロム起動して進めていたら-6キロなのにセーブしてしまった、
絶好調になってしまったのにセーブしてしまった、
しまった！やり直そう！といった時にロム起動して進めていると取り返しがつかないのです。
勿論、上に書いてあるようににCPからロムに牧場データを戻すことは可能です。
ただ、そのCPのデータが無いと話になりません。
基本的にロムで進めているとそのCPのデータが7月1週止まりになってしまうことが致命的な問題となります。
そのためCP起動し、CPにセーブするという形で戦績積みは進めていくことがベストとなります。

これが一番生きてくる場面がベスト体重が増える時期での確認でしょう。
この時期では-2キロが出てもそれで終わりとなりません。その後のベスト体重確認をしてようやく1戦が終わることになります。
この時にCP(A)で起動していたならばそのままCP(A)にセーブしてしまってもいけません。
CP(A)で起動し、レース後すぐにCP(B)にセーブ。そしてCP(B)にて再起動。
ベスト体重確認後、問題なければそのまま戦績積み継続。増えていたらCP(A)に戻れば良いのです。
他にもレース後の順調チェックする時の調教で故障することが少なくありません。
その時にも(A)で起動し、レース後すぐにCP(B)にセーブ。そしてCP(B)にて再起動という手順を踏んでいれば、
CP(B)で再起動後に故障してももう一度CP(B)で再起動し、乱数を変えた後に調教すれば良いだけの話です。
勿論それで絶好調になってしまったのであればCP(A)に戻れば良いのです。